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Please use this identifier to cite or link to this thesis: http://hdl.handle.net/10589/85242

Author: CHINNICI, GIUSEPPA
Supervisor: DE MOMI, ELENA
Scientific Disciplinary Sector: ING-INF/06 BIOINGEGNERIA ELETTRONICA E INFORMATICA
Date: 3-Oct-2013
Academic year: 2012/2013
Title: Brain cortical thickness of MRI visible focal cortical dysplasia type II : a retrospective controlled study
Italian abstract: FreeSurfer è un software che fornisce un tool in grado di effettuare la misurazione automatica dello spessore della corteccia cerebrale. Il suo uso è diffuso, nonostante sia stato validato soltanto confrontando i valori di spessore stimati con le misure effettuate sulle scansioni di risonanza magnetica di due cervelli estratti dal cranio (post-mortem). La misura dello spessore corticale è una tecnica sempre più utilizzata per lo studio di malattie neurologiche come epilessia, corea di Huntington, Alzeheimer e displasia corticale focale (DCF). Durante questo lavoro, ho confrontato i valori di spessore corticale ottenuti utilizzando FreeSurfer con misurazioni manuali effettuate su 27 campioni istologici provenienti dalla chirurgia dell’epilessia. L’analisi dei risultati, effettuata utilizzando la regressione di Passing-Bablock e il grafico di Bland-Altman, mostra una buona corrispondenza tra le stime di FreeSurfer e le misurazioni istologiche di spessore corticale. Valutato il metodo di stima dello spessore di FreeSurfer, è stato approfondito lo studio delle DCF facendo un’analisi morfometrica, con particolare attenzione allo spessore corticale. Ho effettuato l’analisi su 20 pazienti affetti da DCF tipo II di Taylor in corrispondenza della zona lesionale; i risultati sono stati confrontati con i valori ottenuti in aree cerebrali corrispondenti su 40 soggetti di controllo sani. L’analisi effettuata con il t-test mostra differenze statisticamente significative nello spessore corticale tra i due gruppi. Il confronto risulta utile per identificare caratteristiche ricorrenti in tutte le lesioni. Queste caratteristiche possono aiutare nella diagnosi di DCF che non sono visibile all’esame radiologico ispettivo.
English abstract: FreeSurfer is a software package that provides automatic cortical thickness estimation. Its use is widely accepted, albeit this tool was validated against histological measurements in only two post-mortem isolated brain MRI scans. The cortical thickness measurement is a technique increasingly used for the study of several neurological diseases such as epilepsy, Huntington's Chorea, Alzheimer's disease, focal cortical dysplasia (FCD). During this work I have been able to compare cortical thickness values obtained by the automatic software pipeline with manual histologic measurements performed in 27 histological specimens resected for the treatment of drug-resistant partial epilepsy. This study, including Passing-Bablok regression and Bland-Altman plot analysis, shows a good agreement between FreeSurfer estimates and histologic measurements of brain cortical thickness. Once validated the method of measurement in FreeSurfer I decided to deepen the study of the FCD conducting a morphometric analysis of the same. I performed, with FreeSurfer, a morphometric analysis of the cerebral cortex of 20 patients with Taylor-type II FCD in correspondence of the lesion; these results are compared with those obtained by the analysis of the cortex of 40 healthy subjects in the same areas. The analysis with two-paired sample t-test shown significant difference between cortical thickness of two groups. The comparison may be useful to identify recurring features in all lesions. Such characteristics are helpful in the diagnosis of dysplasia that is not recognizable to the visual radiological inspection.
Italian keywords: Free Surfer; spessore corticale; displasia corticale focale
English keywords: Free Surfer; cortical thickness; focal cortical dysplasia
Language: eng
Appears in Collections:POLITesi >Tesi Specialistiche/Magistrali

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